Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps50Q8CI71 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps50Q8CI71 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps50Q8CI71 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps50Q8CI71 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps50Q8CI71 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms