Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG27

Actl9, Actin-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actl9Q8CG27 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Actl9Q8CG27 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actl9Q8CG27 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actl9Q8CG27 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Actl9Q8CG27 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actl9Q8CG27 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Actl9Q8CG27 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actl9Q8CG27 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actl9Q8CG27 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms