Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA1

Irak2, Interleukin-1 receptor-associated kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak2Q8CFA1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irak2Q8CFA1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irak2Q8CFA1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak2Q8CFA1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak2Q8CFA1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak2Q8CFA1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak2Q8CFA1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak2Q8CFA1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak2Q8CFA1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Irak2Q8CFA1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irak2Q8CFA1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irak2Q8CFA1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms