Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp27Q8CEG8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp27Q8CEG8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp27Q8CEG8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp27Q8CEG8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp27Q8CEG8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp27Q8CEG8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms