Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc73Q8CDM4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc73Q8CDM4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc73Q8CDM4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc73Q8CDM4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc73Q8CDM4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms