Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlrc3Q8CCH2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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