Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4bQ8C6J9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4bQ8C6J9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlrp4bQ8C6J9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp4bQ8C6J9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms