Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr33Q8C494 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr33Q8C494 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr33Q8C494 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr33Q8C494 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prr33Q8C494 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr33Q8C494 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr33Q8C494 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prr33Q8C494 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr33Q8C494 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr33Q8C494 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr33Q8C494 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr33Q8C494 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms