Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm4aQ8BW72 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm4aQ8BW72 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm4aQ8BW72 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm4aQ8BW72 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kdm4aQ8BW72 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms