Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW45

E330021D16Rik, RIKEN cDNA E330021D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330021D16RikQ8BW45 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E330021D16RikQ8BW45 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E330021D16RikQ8BW45 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330021D16RikQ8BW45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
E330021D16RikQ8BW45 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E330021D16RikQ8BW45 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330021D16RikQ8BW45 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330021D16RikQ8BW45 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330021D16RikQ8BW45 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E330021D16RikQ8BW45 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E330021D16RikQ8BW45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330021D16RikQ8BW45 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330021D16RikQ8BW45 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330021D16RikQ8BW45 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms