Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVC4

Ccdc68, Coiled-coil domain-containing protein 68, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc68Q8BVC4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.2 ms