Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVC4

Ccdc68, Coiled-coil domain-containing protein 68, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc68Q8BVC4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc68Q8BVC4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc68Q8BVC4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc68Q8BVC4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc68Q8BVC4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc68Q8BVC4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms