Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmco3Q8BH01 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmco3Q8BH01 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco3Q8BH01 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmco3Q8BH01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco3Q8BH01 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms