Protein–RNA interactions for Protein: Q810P3

Cdkn3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn3Q810P3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkn3Q810P3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkn3Q810P3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkn3Q810P3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkn3Q810P3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkn3Q810P3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkn3Q810P3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn3Q810P3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn3Q810P3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkn3Q810P3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn3Q810P3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn3Q810P3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn3Q810P3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdkn3Q810P3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkn3Q810P3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms