Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec4b1Q7TS58 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clec4b1Q7TS58 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec4b1Q7TS58 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec4b1Q7TS58 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms