Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl3Q6P1Y1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl3Q6P1Y1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl3Q6P1Y1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtl3Q6P1Y1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl3Q6P1Y1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl3Q6P1Y1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl3Q6P1Y1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl3Q6P1Y1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtl3Q6P1Y1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtl3Q6P1Y1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl3Q6P1Y1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl3Q6P1Y1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtl3Q6P1Y1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtl3Q6P1Y1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl3Q6P1Y1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl3Q6P1Y1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtl3Q6P1Y1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtl3Q6P1Y1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtl3Q6P1Y1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl3Q6P1Y1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtl3Q6P1Y1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms