Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23,71■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Sh3rf1Q69ZI1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Sh3rf1Q69ZI1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23,64■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Sh3rf1Q69ZI1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23,56■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Sh3rf1Q69ZI1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Sh3rf1Q69ZI1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Sh3rf1Q69ZI1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
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