Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EsrrbQ61539 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EsrrbQ61539 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EsrrbQ61539 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EsrrbQ61539 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EsrrbQ61539 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms