Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd200r3Q5UKY4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd200r3Q5UKY4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd200r3Q5UKY4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms