Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctc1Q5SUQ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctc1Q5SUQ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctc1Q5SUQ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctc1Q5SUQ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctc1Q5SUQ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctc1Q5SUQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctc1Q5SUQ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms