Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam71bQ5STT6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam71bQ5STT6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71bQ5STT6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71bQ5STT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms