Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc58Q3UGP9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc58Q3UGP9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc58Q3UGP9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc58Q3UGP9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc58Q3UGP9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms