Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3U7U4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U7U4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3U7U4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3U7U4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U7U4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U7U4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3U7U4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3U7U4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3U7U4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3U7U4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U7U4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U7U4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3U7U4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3U7U4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3U7U4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3U7U4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3U7U4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3U7U4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms