Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam193bQ3U2K0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam193bQ3U2K0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam193bQ3U2K0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam193bQ3U2K0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam193bQ3U2K0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam193bQ3U2K0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam193bQ3U2K0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam193bQ3U2K0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam193bQ3U2K0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam193bQ3U2K0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam193bQ3U2K0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms