Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc102aQ3TMW1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc102aQ3TMW1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc102aQ3TMW1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc102aQ3TMW1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms