Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde12Q3TIU4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde12Q3TIU4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde12Q3TIU4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde12Q3TIU4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde12Q3TIU4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde12Q3TIU4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms