Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc69Q3TCJ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc69Q3TCJ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms