Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdgfl1Q2VPR5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hdgfl1Q2VPR5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms