Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 CRC1YOR100C 984 nt8.87□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 PET494YNR045W 1470 nt8.86□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 YJR149WYJR149W 1215 nt8.86□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 CAK1YFL029C 1107 nt8.85□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 RPD3YNL330C 1302 nt8.84□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 YJL043WYJL043W 774 nt8.84□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 LSR1LSR1 1175 nt8.84□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 YLR460CYLR460C 1131 nt8.83□□□□□ -1
RTP1Q12751 YPR084WYPR084W 1371 nt8.83□□□□□ -1
RTP1Q12751 NSG2YNL156C 900 nt8.82□□□□□ -1
RTP1Q12751 VMA11YPL234C 495 nt8.81□□□□□ -1
RTP1Q12751 TDH1YJL052W 999 nt8.8□□□□□ -1
RTP1Q12751 GAS1YMR307W 1680 nt8.8□□□□□ -1
RTP1Q12751 MEX67YPL169C 1800 nt8.8□□□□□ -1
RTP1Q12751 OCH1YGL038C 1443 nt8.8□□□□□ -1
RTP1Q12751 PTC6YCR079W 1329 nt8.8□□□□□ -1
RTP1Q12751 NUP53YMR153W 1428 nt8.79□□□□□ -1
RTP1Q12751 KGD2YDR148C 1392 nt8.78□□□□□ -1
RTP1Q12751 CHS7YHR142W 951 nt8.78□□□□□ -1
RTP1Q12751 AAC3YBR085W 924 nt8.78□□□□□ -1
RTP1Q12751 RPS6AYPL090C 711 nt8.77□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 RPS6BYBR181C 711 nt8.77□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 MET8YBR213W 825 nt8.77□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 MDL2YPL270W 2322 nt8.77□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 DPL1YDR294C 1770 nt8.76□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 BXI1YNL305C 894 nt8.76□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 KRR1YCL059C 951 nt8.75□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 SBP1YHL034C 885 nt8.75□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 RPC31YNL151C 756 nt8.75□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 FET5YFL041W 1869 nt8.74□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 NAS6YGR232W 687 nt8.74□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 MET22YOL064C 1074 nt8.74□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 YLR173WYLR173W 1827 nt8.73□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 MTO1YGL236C 2010 nt8.72□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 ATP2YJR121W 1536 nt8.72□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 RPR1RPR1 369 nt8.72□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 COS10YNR075W 1125 nt8.72□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 SNX3YOR357C 489 nt8.72□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 PAB1YER165W 1734 nt8.71□□□□□ -1.01
RTP1Q12751 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 OLA1YBR025C 1185 nt8.71□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 HBS1YKR084C 1836 nt8.7□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 YDR476CYDR476C 675 nt8.7□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 MIM1YOL026C 342 nt8.7□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 PDC6YGR087C 1692 nt8.69□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 INH1YDL181W 258 nt8.69□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 YBL095WYBL095W 813 nt8.69□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 LEU4YNL104C 1860 nt8.68□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 CBK1YNL161W 2271 nt8.68□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 YPT31YER031C 672 nt8.67□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 DUR3YHL016C 2208 nt8.65□□□□□ -1.02
RTP1Q12751 MLS1YNL117W 1665 nt8.64□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 YIL168WYIL168W 384 nt8.62□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 NPP2YEL016C 1482 nt8.62□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 SNU66YOR308C 1764 nt8.61□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 YHR131CYHR131C 2553 nt8.61□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 RNA170RNA170 169 nt8.61□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 FIT1YDR534C 1587 nt8.61□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.6□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.6□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 RRT6YGL146C 936 nt8.6□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 MGM101YJR144W 810 nt8.6□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 YLR358CYLR358C 564 nt8.6□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 PUP2YGR253C 783 nt8.59□□□□□ -1.03
RTP1Q12751 TOM71YHR117W 1920 nt8.58□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 YIR035CYIR035C 765 nt8.58□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 YML079WYML079W 606 nt8.58□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 UFD1YGR048W 1086 nt8.57□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 PSP2YML017W 1782 nt8.57□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 GGA2YHR108W 1758 nt8.56□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 HXT11YOL156W 1704 nt8.55□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 URA1YKL216W 945 nt8.55□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 RHO1YPR165W 630 nt8.55□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 YIL177CYIL177C 5277 nt8.54□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.54□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 DUS3YLR401C 2007 nt8.54□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.53□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.53□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.53□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 PMU1YKL128C 888 nt8.53□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 ORT1YOR130C 879 nt8.53□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 ECM27YJR106W 2178 nt8.53□□□□□ -1.04
RTP1Q12751 ADE2YOR128C 1716 nt8.52□□□□□ -1.05
RTP1Q12751 HAC1YFL031W 717 nt8.52□□□□□ -1.05
RTP1Q12751 RTG2YGL252C 1767 nt8.52□□□□□ -1.05
RTP1Q12751 TPN1YGL186C 1740 nt8.51□□□□□ -1.05
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