Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 MEP1YGR121C 1479 nt7.72□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.72□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.72□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.72□□□□□ -1.17
RRP42Q12277 YJL160CYJL160C 864 nt7.71□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 RHO1YPR165W 630 nt7.71□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 HXT11YOL156W 1704 nt7.71□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 YPT31YER031C 672 nt7.7□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 YIL177CYIL177C 5277 nt7.69□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 THI73YLR004C 1572 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 PET18YCR020C 648 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 YMR210WYMR210W 1350 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 YPR084WYPR084W 1371 nt7.67□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 ERG6YML008C 1152 nt7.66□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 HIS3YOR202W 663 nt7.66□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 PUP3YER094C 618 nt7.65□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 MFT1YML062C 1179 nt7.65□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 YMR206WYMR206W 942 nt7.65□□□□□ -1.18
RRP42Q12277 YLR072WYLR072W 2082 nt7.64□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 NDE2YDL085W 1638 nt7.64□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 SRM1YGL097W 1449 nt7.64□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 RCF1YML030W 480 nt7.64□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 LEA1YPL213W 717 nt7.64□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 INO1YJL153C 1602 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 BUD31YCR063W 474 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 NSG2YNL156C 900 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 BXI1YNL305C 894 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 MIM1YOL026C 342 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 RPS6AYPL090C 711 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 RPS6BYBR181C 711 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 MEX67YPL169C 1800 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 EHT1YBR177C 1356 nt7.62□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 YER156CYER156C 1017 nt7.62□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 LRO1YNR008W 1986 nt7.61□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.61□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 SHC1YER096W 1539 nt7.61□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 LPD1YFL018C 1500 nt7.61□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 YGR137WYGR137W 375 nt7.6□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 MAS1YLR163C 1389 nt7.59□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 ABP1YCR088W 1779 nt7.59□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 ORT1YOR130C 879 nt7.59□□□□□ -1.19
RRP42Q12277 UTR5YEL035C 501 nt7.58□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 TDA4YJR116W 840 nt7.58□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 PRE10YOR362C 867 nt7.58□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 POP2YNR052C 1302 nt7.57□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 GRH1YDR517W 1119 nt7.57□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 WSC3YOL105C 1671 nt7.57□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 YLR173WYLR173W 1827 nt7.57□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 TGL5YOR081C 2250 nt7.57□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 PMU1YKL128C 888 nt7.56□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 YNL140CYNL140C 570 nt7.56□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 HBS1YKR084C 1836 nt7.56□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 HXT8YJL214W 1710 nt7.55□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 TIF3YPR163C 1311 nt7.55□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 INM1YHR046C 888 nt7.55□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 FTH1YBR207W 1398 nt7.55□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 DUR3YHL016C 2208 nt7.55□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 DIP5YPL265W 1827 nt7.55□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 ADA2YDR448W 1305 nt7.54□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 TIM50YPL063W 1431 nt7.54□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 GLY1YEL046C 1164 nt7.54□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.54□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 UFD1YGR048W 1086 nt7.54□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 ATP2YJR121W 1536 nt7.52□□□□□ -1.2
RRP42Q12277 JHD1YER051W 1479 nt7.52□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.52□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 RTG2YGL252C 1767 nt7.51□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 ELP4YPL101W 1371 nt7.51□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 TDH1YJL052W 999 nt7.51□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 MRP7YNL005C 1116 nt7.51□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 GDH1YOR375C 1365 nt7.5□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 MRP1YDR347W 966 nt7.5□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 YIL168WYIL168W 384 nt7.5□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 snR4snR4 186 nt7.5□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 ALG7YBR243C 1347 nt7.5□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 TAD2YJL035C 753 nt7.49□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 MRN1YPL184C 1839 nt7.49□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 ARO3YDR035W 1113 nt7.48□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 FIT1YDR534C 1587 nt7.48□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 HRA1HRA1 564 nt7.48□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 PAU21YOR394W 495 nt7.48□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 PAU22YPL282C 495 nt7.48□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 ARG7YMR062C 1326 nt7.48□□□□□ -1.21
RRP42Q12277 SNP1YIL061C 903 nt7.46□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 GNP1YDR508C 1992 nt7.46□□□□□ -1.22
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