Protein–RNA interactions for Protein: Q12159

YRA1, RNA annealing protein YRA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRA1Q12159 MRS4YKR052C 915 nt7.24□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 YLR460CYLR460C 1131 nt7.24□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 YMR166CYMR166C 1107 nt7.23□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 LSP1YPL004C 1026 nt7.23□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 TMS1YDR105C 1422 nt7.23□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 YRF1-2YER190W 5046 nt7.23□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 YJL160CYJL160C 864 nt7.22□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 MET22YOL064C 1074 nt7.22□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 AAT1YKL106W 1356 nt7.21□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 YJL045WYJL045W 1905 nt7.21□□□□□ -1.25
YRA1Q12159 YJR149WYJR149W 1215 nt7.21□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 RNA170RNA170 169 nt7.21□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 OCH1YGL038C 1443 nt7.2□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 CAK1YFL029C 1107 nt7.2□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 CHS7YHR142W 951 nt7.2□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 PET18YCR020C 648 nt7.19□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 YIR035CYIR035C 765 nt7.19□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 DUR3YHL016C 2208 nt7.19□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 ALD5YER073W 1563 nt7.18□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 YPL247CYPL247C 1572 nt7.18□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 PDC6YGR087C 1692 nt7.17□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 STF1YDL130W-A 261 nt7.17□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 MRP1YDR347W 966 nt7.17□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 RRT14YIL127C 621 nt7.17□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 YJL009WYJL009W 327 nt7.17□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 BUB2YMR055C 921 nt7.17□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 OLA1YBR025C 1185 nt7.17□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 YMR210WYMR210W 1350 nt7.17□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 YBR056WYBR056W 1506 nt7.17□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 snR86snR86 1004 nt7.16□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 EMC3YKL207W 762 nt7.16□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 FET5YFL041W 1869 nt7.15□□□□□ -1.26
YRA1Q12159 TRP2YER090W 1524 nt7.14□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 MEP1YGR121C 1479 nt7.14□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 NBA1YOL070C 1506 nt7.14□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 ECM10YEL030W 1935 nt7.13□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 YHL008CYHL008C 1884 nt7.11□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 YER156CYER156C 1017 nt7.11□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 PRE5YMR314W 705 nt7.11□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 RHO1YPR165W 630 nt7.11□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 SDH8YBR269C 417 nt7.11□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 YLR072WYLR072W 2082 nt7.11□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 ALR1YOL130W 2580 nt7.11□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 BAP3YDR046C 1815 nt7.11□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 UTR5YEL035C 501 nt7.1□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 BXI1YNL305C 894 nt7.1□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 RPS6AYPL090C 711 nt7.1□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 RPS6BYBR181C 711 nt7.1□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 Q0010Q0010 387 nt7.1□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 HXT11YOL156W 1704 nt7.1□□□□□ -1.27
YRA1Q12159 SHC1YER096W 1539 nt7.08□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 KAE1YKR038C 1161 nt7.08□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 YPT31YER031C 672 nt7.07□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 THI73YLR004C 1572 nt7.07□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 PUP3YER094C 618 nt7.06□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 MFT1YML062C 1179 nt7.06□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 YPR084WYPR084W 1371 nt7.06□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 LRO1YNR008W 1986 nt7.06□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 ADA2YDR448W 1305 nt7.05□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 EHT1YBR177C 1356 nt7.05□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.04□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 GUT1YHL032C 2130 nt7.04□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 SRM1YGL097W 1449 nt7.03□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 ABP1YCR088W 1779 nt7.03□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 ATP2YJR121W 1536 nt7.03□□□□□ -1.28
YRA1Q12159 HIS3YOR202W 663 nt7.02□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 LEA1YPL213W 717 nt7.02□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 GDH1YOR375C 1365 nt7.02□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 HXT8YJL214W 1710 nt7.01□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 INO1YJL153C 1602 nt7.01□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 DIP5YPL265W 1827 nt6.99□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 ELP4YPL101W 1371 nt6.99□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 BUD31YCR063W 474 nt6.99□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 RCF1YML030W 480 nt6.99□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 TIM50YPL063W 1431 nt6.99□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 JHD1YER051W 1479 nt6.98□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 TAD2YJL035C 753 nt6.98□□□□□ -1.29
YRA1Q12159 MDL2YPL270W 2322 nt6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.3 ms