Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pglyrp4Q0VB07 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pglyrp4Q0VB07 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pglyrp4Q0VB07 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pglyrp4Q0VB07 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms