Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Crisp3Q03402 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Crisp3Q03402 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Crisp3Q03402 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp3Q03402 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms