Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga4Q00651 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga4Q00651 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga4Q00651 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga4Q00651 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga4Q00651 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga4Q00651 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms