Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HmmrQ00547 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HmmrQ00547 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HmmrQ00547 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HmmrQ00547 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HmmrQ00547 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HmmrQ00547 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HmmrQ00547 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms