Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mesp1P97309 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mesp1P97309 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mesp1P97309 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mesp1P97309 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mesp1P97309 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mesp1P97309 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms