Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf6P70196 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf6P70196 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf6P70196 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf6P70196 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf6P70196 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf6P70196 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf6P70196 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf6P70196 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf6P70196 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf6P70196 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf6P70196 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf6P70196 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf6P70196 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf6P70196 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Traf6P70196 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf6P70196 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf6P70196 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf6P70196 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf6P70196 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf6P70196 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf6P70196 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf6P70196 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf6P70196 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms