Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Traf5P70191 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Traf5P70191 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Traf5P70191 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Traf5P70191 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Traf5P70191 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Traf5P70191 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Traf5P70191 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Traf5P70191 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Traf5P70191 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Traf5P70191 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Traf5P70191 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Traf5P70191 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Traf5P70191 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Traf5P70191 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Traf5P70191 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Traf5P70191 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Traf5P70191 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Traf5P70191 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Traf5P70191 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Traf5P70191 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Traf5P70191 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Traf5P70191 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Traf5P70191 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Traf5P70191 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Traf5P70191 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Traf5P70191 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Traf5P70191 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Traf5P70191 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Traf5P70191 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Traf5P70191 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Traf5P70191 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Traf5P70191 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Traf5P70191 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Traf5P70191 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf5P70191 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Traf5P70191 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Traf5P70191 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Traf5P70191 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms