Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps27aP62983 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps27aP62983 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps27aP62983 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27aP62983 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms