Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ElobP62869 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ElobP62869 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ElobP62869 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ElobP62869 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ElobP62869 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ElobP62869 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ElobP62869 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ElobP62869 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ElobP62869 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ElobP62869 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ElobP62869 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ElobP62869 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ElobP62869 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ElobP62869 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ElobP62869 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ElobP62869 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ElobP62869 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ElobP62869 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ElobP62869 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ElobP62869 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ElobP62869 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ElobP62869 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ElobP62869 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ElobP62869 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ElobP62869 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ElobP62869 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ElobP62869 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ElobP62869 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ElobP62869 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ElobP62869 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ElobP62869 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ElobP62869 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ElobP62869 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ElobP62869 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ElobP62869 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ElobP62869 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ElobP62869 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ElobP62869 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ElobP62869 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ElobP62869 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ElobP62869 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ElobP62869 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ElobP62869 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ElobP62869 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ElobP62869 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ElobP62869 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ElobP62869 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ElobP62869 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ElobP62869 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ElobP62869 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ElobP62869 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ElobP62869 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ElobP62869 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ElobP62869 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ElobP62869 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ElobP62869 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ElobP62869 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ElobP62869 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ElobP62869 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ElobP62869 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ElobP62869 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ElobP62869 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ElobP62869 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ElobP62869 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ElobP62869 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ElobP62869 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ElobP62869 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ElobP62869 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ElobP62869 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ElobP62869 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ElobP62869 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ElobP62869 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ElobP62869 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ElobP62869 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ElobP62869 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ElobP62869 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ElobP62869 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ElobP62869 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ElobP62869 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ElobP62869 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ElobP62869 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ElobP62869 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ElobP62869 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ElobP62869 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ElobP62869 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ElobP62869 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ElobP62869 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ElobP62869 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ElobP62869 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ElobP62869 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ElobP62869 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ElobP62869 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ElobP62869 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ElobP62869 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ElobP62869 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ElobP62869 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ElobP62869 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ElobP62869 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ElobP62869 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms