Protein–RNA interactions for Protein: P62482

Kcnab2, Voltage-gated potassium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab2P62482 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnab2P62482 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab2P62482 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnab2P62482 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnab2P62482 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnab2P62482 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnab2P62482 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms