Protein–RNA interactions for Protein: P56387

Dynlt3, Dynein light chain Tctex-type 3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dynlt3P56387 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dynlt3P56387 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dynlt3P56387 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dynlt3P56387 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dynlt3P56387 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dynlt3P56387 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dynlt3P56387 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dynlt3P56387 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms