Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ClgnP52194 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClgnP52194 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClgnP52194 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClgnP52194 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClgnP52194 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ClgnP52194 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClgnP52194 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ClgnP52194 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClgnP52194 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClgnP52194 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClgnP52194 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClgnP52194 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClgnP52194 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ClgnP52194 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClgnP52194 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClgnP52194 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClgnP52194 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ClgnP52194 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClgnP52194 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClgnP52194 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClgnP52194 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms