Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LtbP41155 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LtbP41155 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LtbP41155 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LtbP41155 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LtbP41155 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LtbP41155 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LtbP41155 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LtbP41155 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LtbP41155 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LtbP41155 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LtbP41155 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LtbP41155 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LtbP41155 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LtbP41155 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LtbP41155 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LtbP41155 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LtbP41155 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LtbP41155 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LtbP41155 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LtbP41155 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LtbP41155 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LtbP41155 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LtbP41155 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LtbP41155 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LtbP41155 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LtbP41155 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LtbP41155 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LtbP41155 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LtbP41155 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LtbP41155 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LtbP41155 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LtbP41155 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LtbP41155 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LtbP41155 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LtbP41155 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LtbP41155 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LtbP41155 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LtbP41155 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LtbP41155 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LtbP41155 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LtbP41155 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LtbP41155 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LtbP41155 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LtbP41155 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LtbP41155 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LtbP41155 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LtbP41155 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LtbP41155 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LtbP41155 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LtbP41155 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LtbP41155 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LtbP41155 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LtbP41155 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LtbP41155 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LtbP41155 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LtbP41155 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LtbP41155 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LtbP41155 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LtbP41155 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LtbP41155 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LtbP41155 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LtbP41155 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LtbP41155 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LtbP41155 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LtbP41155 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LtbP41155 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LtbP41155 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LtbP41155 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LtbP41155 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LtbP41155 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LtbP41155 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbP41155 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbP41155 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbP41155 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbP41155 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbP41155 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbP41155 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbP41155 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbP41155 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbP41155 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbP41155 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbP41155 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbP41155 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbP41155 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbP41155 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbP41155 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbP41155 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbP41155 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LtbP41155 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbP41155 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbP41155 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbP41155 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbP41155 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbP41155 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbP41155 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbP41155 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbP41155 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbP41155 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbP41155 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms