Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptger1P35375 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptger1P35375 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptger1P35375 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptger1P35375 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptger1P35375 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptger1P35375 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptger1P35375 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptger1P35375 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptger1P35375 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptger1P35375 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptger1P35375 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ptger1P35375 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptger1P35375 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms