Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Saa4P31532 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Saa4P31532 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Saa4P31532 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Saa4P31532 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Saa4P31532 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Saa4P31532 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Saa4P31532 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms