Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb9P20615 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb9P20615 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb9P20615 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb9P20615 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb9P20615 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxb9P20615 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxb9P20615 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb9P20615 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb9P20615 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb9P20615 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb9P20615 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb9P20615 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms