Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lama1P19137 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lama1P19137 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lama1P19137 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lama1P19137 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lama1P19137 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lama1P19137 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lama1P19137 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lama1P19137 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lama1P19137 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lama1P19137 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lama1P19137 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama1P19137 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama1P19137 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lama1P19137 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama1P19137 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama1P19137 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lama1P19137 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lama1P19137 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama1P19137 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama1P19137 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama1P19137 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama1P19137 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms