Protein–RNA interactions for Protein: P0C2J7

TY4B-H, Transposon Ty4-H Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4B-HP0C2J7 ESBP6YNL125C 2022 nt10.27□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 OLA1YBR025C 1185 nt10.26□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 TMS1YDR105C 1422 nt10.25□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 ATP2YJR121W 1536 nt10.25□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 THI73YLR004C 1572 nt10.25□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt10.23□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 LAT1YNL071W 1449 nt10.23□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 CPT1YNL130C 1182 nt10.23□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 UME1YPL139C 1383 nt10.22□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 SLM3YDL033C 1254 nt10.22□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 YIR035CYIR035C 765 nt10.22□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 CMP2YML057W 1815 nt10.22□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 PNS1YOR161C 1620 nt10.22□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 PSP2YML017W 1782 nt10.22□□□□□ -0.77
TY4B-HP0C2J7 ODC1YPL134C 933 nt10.21□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 MEP1YGR121C 1479 nt10.2□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 HXT8YJL214W 1710 nt10.19□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 SPG1YGR236C 288 nt10.19□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 TIM50YPL063W 1431 nt10.18□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 DPL1YDR294C 1770 nt10.17□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 PUS4YNL292W 1212 nt10.17□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 SPE3YPR069C 882 nt10.17□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 JHD1YER051W 1479 nt10.16□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 YOR111WYOR111W 699 nt10.16□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 YJL009WYJL009W 327 nt10.15□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 YBL111CYBL111C 2004 nt10.15□□□□□ -0.78
TY4B-HP0C2J7 YOX1YML027W 1158 nt10.14□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 CST26YBR042C 1194 nt10.14□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 YDR467CYDR467C 327 nt10.13□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 ADH6YMR318C 1083 nt10.13□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 DOC1YGL240W 753 nt10.12□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt10.12□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt10.1□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt10.1□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 MDM35YKL053C-A 261 nt10.1□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 YMC2YBR104W 990 nt10.1□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 YBR056WYBR056W 1506 nt10.09□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 ZIM17YNL310C 525 nt10.09□□□□□ -0.79
TY4B-HP0C2J7 LEU4YNL104C 1860 nt10.08□□□□□ -0.8
TY4B-HP0C2J7 YHR218WYHR218W 1812 nt10.08□□□□□ -0.8
TY4B-HP0C2J7 BUB2YMR055C 921 nt10.07□□□□□ -0.8
TY4B-HP0C2J7 MAS2YHR024C 1449 nt10.06□□□□□ -0.8
TY4B-HP0C2J7 CRN1YLR429W 1956 nt10.06□□□□□ -0.8
TY4B-HP0C2J7 MRS4YKR052C 915 nt10.06□□□□□ -0.8
TY4B-HP0C2J7 PRE10YOR362C 867 nt10.04□□□□□ -0.8
TY4B-HP0C2J7 ALG7YBR243C 1347 nt10.03□□□□□ -0.8
TY4B-HP0C2J7 LRO1YNR008W 1986 nt10.02□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 BUD31YCR063W 474 nt10.02□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 PMU1YKL128C 888 nt10.02□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 YPQ1YOL092W 927 nt10.02□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 snR86snR86 1004 nt10.01□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 PDA1YER178W 1263 nt10□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 TPN1YGL186C 1740 nt10□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 AAT1YKL106W 1356 nt9.99□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 ARG7YMR062C 1326 nt9.98□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 YML034C-AYML034C-A 399 nt9.98□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 DIP5YPL265W 1827 nt9.96□□□□□ -0.81
TY4B-HP0C2J7 HIS2YFR025C 1008 nt9.95□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 TRR2YHR106W 1029 nt9.95□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 SPS1YDR523C 1473 nt9.95□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 YGL081WYGL081W 963 nt9.94□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 CDC3YLR314C 1563 nt9.94□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 PMP3YDR276C 168 nt9.93□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 RCF1YML030W 480 nt9.93□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 MBF1YOR298C-A 456 nt9.93□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 PSA1YDL055C 1086 nt9.92□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 PTH2YBL057C 627 nt9.92□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 PLB3YOL011W 2061 nt9.92□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 NPP2YEL016C 1482 nt9.92□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 NMA2YGR010W 1188 nt9.91□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 YJR142WYJR142W 1029 nt9.91□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 EHT1YBR177C 1356 nt9.91□□□□□ -0.82
TY4B-HP0C2J7 ERV2YPR037C 591 nt9.89□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 ARO3YDR035W 1113 nt9.89□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 AIM46YHR199C 933 nt9.89□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 LDB7YBL006C 543 nt9.89□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 CKI1YLR133W 1749 nt9.88□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 GAL83YER027C 1254 nt9.87□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 TES1YJR019C 1050 nt9.86□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 AVO2YMR068W 1281 nt9.86□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 OSM1YJR051W 1506 nt9.85□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 AGP3YFL055W 1677 nt9.84□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 MPH3YJR160C 1809 nt9.84□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 YER152CYER152C 1332 nt9.84□□□□□ -0.83
TY4B-HP0C2J7 BIO3YNR058W 1443 nt9.83□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 MCP1YOR228C 909 nt9.82□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 YPL067CYPL067C 597 nt9.82□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 YMR209CYMR209C 1374 nt9.82□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 AIM20YIL158W 615 nt9.82□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 MTO1YGL236C 2010 nt9.8□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 ERV25YML012W 636 nt9.8□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 PRS4YBL068W 981 nt9.79□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 DSC3YOR223W 879 nt9.79□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 MSI1YBR195C 1269 nt9.79□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 HSL7YBR133C 2484 nt9.78□□□□□ -0.84
TY4B-HP0C2J7 HXT10YFL011W 1641 nt9.77□□□□□ -0.85
TY4B-HP0C2J7 HIS3YOR202W 663 nt9.77□□□□□ -0.85
TY4B-HP0C2J7 ERG10YPL028W 1197 nt9.77□□□□□ -0.85
TY4B-HP0C2J7 NAF1YNL124W 1479 nt9.77□□□□□ -0.85
TY4B-HP0C2J7 KRR1YCL059C 951 nt9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms