Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrlP06879 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrlP06879 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrlP06879 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrlP06879 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrlP06879 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrlP06879 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrlP06879 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrlP06879 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrlP06879 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PrlP06879 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrlP06879 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrlP06879 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrlP06879 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrlP06879 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrlP06879 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrlP06879 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrlP06879 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrlP06879 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrlP06879 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrlP06879 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrlP06879 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrlP06879 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrlP06879 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrlP06879 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PrlP06879 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrlP06879 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrlP06879 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrlP06879 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrlP06879 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrlP06879 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrlP06879 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrlP06879 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrlP06879 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrlP06879 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrlP06879 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrlP06879 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrlP06879 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrlP06879 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrlP06879 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrlP06879 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrlP06879 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrlP06879 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrlP06879 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrlP06879 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrlP06879 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrlP06879 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrlP06879 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrlP06879 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrlP06879 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrlP06879 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrlP06879 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrlP06879 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrlP06879 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PrlP06879 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrlP06879 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrlP06879 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrlP06879 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrlP06879 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrlP06879 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PrlP06879 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrlP06879 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrlP06879 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrlP06879 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrlP06879 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrlP06879 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrlP06879 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrlP06879 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrlP06879 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrlP06879 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrlP06879 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrlP06879 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrlP06879 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrlP06879 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrlP06879 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrlP06879 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrlP06879 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrlP06879 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrlP06879 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrlP06879 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrlP06879 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PrlP06879 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrlP06879 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrlP06879 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrlP06879 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrlP06879 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrlP06879 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrlP06879 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrlP06879 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrlP06879 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PrlP06879 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrlP06879 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrlP06879 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PrlP06879 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PrlP06879 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrlP06879 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrlP06879 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrlP06879 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrlP06879 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrlP06879 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms