Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01728 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01728 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01728 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01728 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01728 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01728 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01728 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01728 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01728 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01728 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01728 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01728 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01728 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01728 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01728 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01728 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01728 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01728 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01728 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01728 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01728 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01728 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01728 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01728 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01728 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01728 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01728 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01728 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01728 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01728 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01728 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01728 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01728 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01728 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01728 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01728 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01728 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01728 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01728 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01728 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01728 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01728 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01728 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01728 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01728 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01728 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01728 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01728 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01728 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01728 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01728 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01728 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01728 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01728 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01728 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01728 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01728 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01728 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01728 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01728 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01728 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01728 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01728 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01728 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01728 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01728 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01728 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01728 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01728 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01728 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01728 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01728 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01728 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01728 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01728 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01728 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01728 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01728 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01728 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01728 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01728 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01728 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01728 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01728 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01728 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01728 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01728 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01728 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01728 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01728 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01728 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01728 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01728 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01728 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01728 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01728 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01728 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01728 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01728 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms